Зоологический музей входит в число самых крупных музеев мира. Он является и одним из старейших музеев России: основан на базе коллекций Зоологического кабинета Кунсткамеры в 1832 году и открыт для публики в 1838 году. В 1896 году коллекции Зоологического музея были перевезены в здание бывшего южного пакгауза Биржи, куда с 1901 года имела доступ широкая публика.
Экспозиция Зоологического музея состоит более чем из 30 000 экспонатов, и это лишь небольшая часть фондов музея, насчитывающих около 15 миллионов единиц хранения. Экспозиция, организованная в систематическом порядке, представляет все основные виды животных - от простейших до приматов. Особенно богаты коллекции птиц и млекопитающих. Демонстрируется значительное число редких, а также вымерших животных. Среди них большой интерес вызывают скелет и чучело «березовского» мамонта, найденного в 1799 году, хорошо сохранившийся детеныш мамонта, обнаруженный в Магаданской области в 1979 г, скелеты кита и вымершего южного слона, чучела дикого верблюда, снежного барса и гигантского варана с острова Комодо. Большую ценность представляют образцы животных, занесенных в Международную красную книгу. Из Кунсткамеры в Зоологический музей передана коллекция животных-уродцев. Отдельно представлено собрание, наглядно демонстрирующее теорию эволюции Дарвина. В фондах музея хранятся экспонаты, собранные экспедициями Н. Н. Миклухо-Маклая, И. Ф. Крузенштерна, Ф. Ф. Беллинсгаузена. В оформлении экспозиции широко используются диорамы, в которых животные показаны в естественных для них условиях обитания.
